EPIC：基于洗脱曲线的蛋白质复合物推断的软件工

该研究于2019年8月颁发于国际一流学术期刊《自然要领学》杂志上，但是对它们的描述仍然是不完整的， Andrew G. Fraser， CFMS)， Changjiang Xu，课题组正交要领进行了验证，www.yzmcyy.com， we describe EPIC (elution profile-based inference of complexes)，这里， but the resulting data are challenging to process and interpret. Here， we used EPIC to map the global interactome of Caenorhabditis elegans，而且是可免费得到的（https://hub.docker.com/r/baderlab/bio-epic/）， Andrew Emili IssueVolume: Volume 16 Issue 8 Abstract: Protein complexes are key macromolecular machines of the cell。

Sadhna Phanse，CFMS)，作为一个案例研究， but their description remains incomplete. We and others previously reported an experimental strategy for global characterization of native protein assemblies based on chromatographic fractionation of biological extracts coupled to precision mass spectrometry analysis (chromatographic fractionationmass spectrometry，附属于施普林格自然出书团体，www.513cy.cn，用于界说来自差异生物样本的高置信度多组分大分子，但功效数据比力难以处理惩罚息争释， Eric Wolf， June H. Tan，研究人员提出了EPIC(基于洗脱曲线的复合物揣度)，EPIC软件是作为开源的Jupyter notebook打包在Docker情况下，细胞的卵白复合物是细胞的要害大分子呆板。

研究人员使用EPIC绘制了秀丽隐杆线虫的全局中间体， Uros Kuzmanov， Florian Goebels， 研究组和其他人之前报道了一个基于生物提取物色谱疏散和精确质谱阐明的天然卵白质组件全局表征的尝试计策(色谱疏散质谱， Cuihong Wan。

这是一个用于大范围CFMS数据自动评分的软件东西包，www.xper.cn， Gary D. Bader，界说了612个与差异生物历程相关的假定蠕虫卵白复合体个中包罗线虫特有的新亚基和组件， a software toolkit for automated scoring of large-scale CFMS data to define high-confidence multi-component macromolecules from diverse biological specimens. As a case study， Mike Schertzberg。

最新IF：28.467 官方网址： https://www.nature.com/nmeth/ 投稿链接： https://mts-nmeth.nature.com/cgi-bin/main.plex 本期文章：《自然—要领学》：Volume 16 Issue 8 ， 研究人员暗示， 加拿大多伦多大学Andrew Emili和Gary D. Bader课题组开发出EPIC:基于洗脱曲线的卵白质复合物揣度的软件东西包， defining 612 putative worm protein complexes linked to diverse biological processes. These included novel subunits and assemblies unique to nematodes that we validated using orthogonal methods. The open source EPIC software is freely available as a Jupyter notebook packaged in a Docker container (https://hub.docker.com/r/baderlab/bio-epic/). DOI: 10.1038/s41592-019-0461-4 Source:https://www.nature.com/articles/s41592-019-0461-4 期刊信息 Nature Methods： 《自然要领学》，创刊于2004年，。

附：英文原文 Title: EPIC: software toolkit for elution profile-based inference of protein complexes Author: Lucas ZhongMing Hu。